區審計局設下列內設機構

（一）辦公室。承辦財務、信訪、保密、宣傳、安全、文明單位建設等綜合性事務工作。負責辦理局機關機構編制、人事管理、工資福利等事宜；負責局機關退休人員管理服務工作；負責干部人事檔案管理工作；負責區審計辦交辦的工作任務。

（二）法制和內部審計股。負責擬訂年度審計項目計劃和規范性文件的草擬、修改和報批；承擔審計業務統計工作；組織貫徹執行審計工作的法律、法規、行政規章、審計準則和指南以及相關規章制度等；負責相關審計事項的審理；負責實施行政執法和審計業務質量的監督檢查，監督審計決定的執行和審計問題整改落實情況；負責辦理審計案件的移送；負責審計結果公告的相關事宜。負責內部審計工作的監督和業務指導。承辦機關政務公開，行政調解、行政復議，行政訴訟和普法依法治理等法治建設工作。

（三）財政綜合審計股。負責審計、督查區本級、區級部門、鄉鎮（街道辦）財政預算執行、決算草案及其他財政收支；負責財政資金專項審計和專項審計調查。負責與區人大相關委員會協調聯系有關審計業務工作。負責審計區級黨委、人大、政府、政協、法院、檢察院、群團機關（含下屬事業單位）及社會團體組織的財政財務收支審計。負責區屬國有及國有資本占控股或主導地位的企業和地方金融機構（含地方非銀行性經營機構）、區屬國有資本占控股或主導地位的金融機構的資產、負債和損益審計。承辦上級審計機關授權或統一組織的審計項目計劃的實施。

（四）投資審計股。負責政府投資和以政府投資為主的建設項目的審計。監督建設項目預算的執行情況及年度決算。對重大項目開展督查；對政府投資和以政府投資為主的建設項目有關的設計，施工、供貨等單位取得建設項目資金的真實性、合法性進行調查；對區級重大工程資金籌集、使用情況進行審計；開展專項審計和審計調查。